Главный запасной магазин аптекарских материалов был построен в 1846 году вдоль Аптекарского проспекта и представлял собой комплекс из протяженного лицевого главного корпуса и двух боковых корпусов, выходивших на проспект торцевыми фасадами. Архитектором зданий, вероятно, стал З. Ф. Краснопевков, в 1830-е гг. работавший в Медико-хирургической академии.

В конце 1890-х гг. Главный магазин объединился с Инструментальным хирургическим заводом в Завод военно-врачебных заготовлений. С этим предприятием связаны первые шаги отечественной лекарственной химии. В частности, здесь впервые в России было налажено массовое производство готовых дозированных лекарственных препаратов — таблеток.

В советское время на предприятии, ставшем Ленинградским химико-фармацевтическим заводом, занимались созданием и производством новых лекарственных препаратов — цитрамона, таблеток витамина С и др.

Завод работал всю блокаду, выпуская медицинские препараты свыше 200 наименований. Ни один из его цехов не был законсервирован.

В 1935 году двухэтажный главный корпус был настроен двумя дополнительными этажами, а в период с 1957 по 1966 год все три корпуса объединили в единое четырёхэтажное П-образное в плане здание.

С 1977 года завод вошел в производственное химико-фармацевтическое объединение «Октябрь». В 1978 году здесь впервые в стране было начато производство валидола в капсулах, освоен выпуск медицинских препаратов в аэрозольной упаковке.

В конце 2016 года бывшая территория предприятия оказалась в собственности холдинга «Эталон ЛенспецСМУ». Застройщик сразу же объявил о планах снести заводские корпуса под жилье. Чтобы не восстанавливать исторические фасады, прибегли к ставшему уже «стандартным» способу – внесли изменения в технический паспорт. В результате корпус по Аптекарскому проспекту стал числиться «сталинкой» 1954 года постройки. В сентябре было получено разрешение на строительство двух восьми- и девятиэтажных жилых домов П-образной формы, торцами выходящих на Аптекарский проспект.

Снос бывшего здания Главного магазина начался в начале декабря, его проводит демонтажная компания «Размах».